Cztery Oddziały znajdują się na terenie Kazimierza Dolnego:
Dwa pozostałe Oddziały to:
Oddział Dom Kuncewiczów, Kamienica Celejowska oraz Oddział Przyrodniczy pozostają w remoncie konserwatorskim i są zamknięte dla zwiedzających.
Obecnie w Kazimierzu Dolnym funkcjonuje tylko Gmach Główny przy Rynku 19, w którym mieści się Galeria Wystaw Czasowych, na której prezentujemy wystawę prac Andrzeja Siemińskiego, oraz Muzeum Sztuki Złotniczej.
Dostępne do zwiedzania są również Oddział Grodzisko Żmijowiska oraz Zamek w Janowcu.